XVI век. История мультфильма уводит зрителя в XVI век, в Японию. В начале века злой демон по имени Аку нападает на одно большое японское селение, уничтожая всё на своём пути. И тогда один молодой самурай попросил трёх мудрецов выковать волшебный меч, наделённый силами добра. Самурай сразился с Аку, который умел перевоплощаться в разных животных, и силы добра победили силы зла. Аку ушёл в горы и окаменел там, а молодой самурай стал предводителем всех самураев и ниндзя. Прошло восемь лет. Во время солнечного затмения, Аку снова восстал из камня. В это время самурай постарел, у него появился маленький сын. Аку снова нападает на те же селения, но на этот раз старому самураю не удалось взять волшебный меч, и он сдаётся, прося жену увезти малыша на обучение. Маленький самурай уплывает на корабле от мамы. Волшебный меч остаётся у матери. Самурай-сын странствует по всему миру, встречая искусных мастеров и многому обучаясь. С ними он обучается искусству верховой езды, ниндзюцу, дзюдо, греко-римской борьбе, кунг-фу и прочим единоборствам. И вот новый самурай возвращается на родину, которая уже полностью во власти злого Аку. Мама, постаревшая, отдаёт ему волшебный меч. Он освобождает отца и других узников. И храбро сражается с Аку. Сам демон Аку пытается перевоплощаться то в осьминога, то в скорпиона, то в жука, но он не может противостоять могучему самураю. И вот, когда юный самурай пытался нанести смертельный удар, Аку применил хитрость: он открыл портал в будущее и бросил туда Самурая. Самурай попадает в необыкновенное будущее, весь мир в котором принадлежит Аку.
