Несмотря на то, что джедаям удаётся сорвать планы неприятеля по уничтожению жизни в галактики и арестовать создателя вируса, Скайуокеру с Кеноби ещё предстоит отвезти учёного на Корусант. Однако, ещё до отправления корабля, стараниями одного из послушных доктору дроидов вирус всё же вырывается на свободу. В то время как остальные оказываются запечатанными в лаборатории, оставшиеся снаружи джедаи срочно отправляются в столицу, чтобы найти антидот и спасти друзей и галактику, однако на пути сталкиваются с весьма серьёзным препятствием.
